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Junín se encuentra ubicado al costado de la Cordillera de Toisán, Parroquia García Moreno, en el area de amortiguamiento de la Reserva Ecológica Cotacachi-Cayapas.

El cantón Cotacachi es diverso en él es posible encontrar un diverso sistema montañoso con mesetas, montañas, cordilleras, valles, colinas y llanuras.

El Recinto, ubicado a 200 m s. n. m., con un clima subtropical, se dedica especialmente a la actividad agrícola y ganadera. El cultivo de palma africana es su fuente económica principal, seguida de cultivos como el cacao, maracuyá y palmito.