Es depositario de la historia e identidad cultural de Cotacachi. En sus salas se exhiben los aspectos etnográficos, arqueológicos, artesanales y musicales, elementos identitarios de la vida de este pueblo. El Museo está distribuido en cuatro áreas.
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En el valle de Manduriacos de la Zona de Intag, los agricultores cultivan esta planta en grandes extensiones, que luego constituyen la materia prima del taller de mujeres organizadas quienes se dedican a realizar esponjas e insumos de baño.
Conserva un estilo neoclásico que combina la arquitectura griega y romana. Luce majestuosa en su altar mayor la imagen de Santa Ana, Patrona del Cantón, que fue adquirida a la comunidad de Azama y a la que veneran muchos devotos.
