Junín se encuentra ubicado al costado de la Cordillera de Toisán, Parroquia García Moreno, en el area de amortiguamiento de la Reserva Ecológica Cotacachi-Cayapas.
Conocida como laguna de los Dioses o Tsui - Cocha es una laguna de origen cratérico. La particularidad de ésta es que en su centro están ubicados dos islotes.
