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Refugio tienen una prodigiosa cantidad de orquídeas y otras flores, de árboles (incluyendo el árbol medicinal Sangre de drago), y de varias epifitas (plantas que crecen sobre otras plantas), como las bromelias.
Junín se encuentra ubicado al costado de la Cordillera de Toisán, Parroquia García Moreno, en el area de amortiguamiento de la Reserva Ecológica Cotacachi-Cayapas.