Ubicado en el ingreso a la Parroquia de Peñaherrera su nombre deriva de una imagen del Señor de Intag que fue colocada en el Río Cristopamba hace más de 100 años.
Junín se encuentra ubicado al costado de la Cordillera de Toisán, Parroquia García Moreno, en el area de amortiguamiento de la Reserva Ecológica Cotacachi-Cayapas.
Es depositario de la historia e identidad cultural de Cotacachi. En sus salas se exhiben los aspectos etnográficos, arqueológicos, artesanales y musicales, elementos identitarios de la vida de este pueblo. El Museo está distribuido en cuatro áreas.
Al visitar el Centro Ceremonial de Wariman es posible recorrer por 3 senderos ancestrales y pirámides truncas que conducen a enfáticos miradores que permiten divisar gran parte del Valle y su riqueza paisajística.
En la parroquia de Plaza Gutiérrez de la Zona Sub tropical de Intag con la ayuda de hábiles manos de mujeres del sector se transforman en artesanías como bolsos, correas, sombreros, mismos que se comercializan en diferentes almacenes de la provincia.
El 21 de marzo de cada año se celebra la entrada al fuego nuevo, es el equinoccio de invierno en donde principalmente las comunidades y comunas indígenas campesinas del cantón Cotacachi festejan este inicio del nuevo año.