Es depositario de la historia e identidad cultural de Cotacachi. En sus salas se exhiben los aspectos etnográficos, arqueológicos, artesanales y musicales, elementos identitarios de la vida de este pueblo. El Museo está distribuido en cuatro áreas.
Ubicado en el ingreso a la Parroquia de Peñaherrera su nombre deriva de una imagen del Señor de Intag que fue colocada en el Río Cristopamba hace más de 100 años.
Refugio tienen una prodigiosa cantidad de orquídeas y otras flores, de árboles (incluyendo el árbol medicinal Sangre de drago), y de varias epifitas (plantas que crecen sobre otras plantas), como las bromelias.