Es depositario de la historia e identidad cultural de Cotacachi. En sus salas se exhiben los aspectos etnográficos, arqueológicos, artesanales y musicales, elementos identitarios de la vida de este pueblo. El Museo está distribuido en cuatro áreas.
Junín se encuentra ubicado al costado de la Cordillera de Toisán, Parroquia García Moreno, en el area de amortiguamiento de la Reserva Ecológica Cotacachi-Cayapas.
Ubicación: Se encuentra ubicado en el sector de Manduriacos, parroquia de García Moreno, cantón Cotacachi.
Superficie: Es un área protegida con más de 6 000 has de bosque primario.
Altura: 1 400 m s. n. m.
Temperatura promedio: 15 – 18ºC
Conocida como laguna de los Dioses o Tsui - Cocha es una laguna de origen cratérico. La particularidad de ésta es que en su centro están ubicados dos islotes.
En Cotacachi existe un acto ritual de especiales características, denominado La Danza de los Yumbos, que se realiza como parte de la celebración del equinoccio de septiembre denominado Hatun Mama o Culto Grande a Santa Anita.
El juego del trompo es utilizado en Cotacachi para los desafíos barriales que tradicionalmente se realizan en la época de finados. Cada equipo tiene un líder que se encarga de promover los desafíos.