Es depositario de la historia e identidad cultural de Cotacachi. En sus salas se exhiben los aspectos etnográficos, arqueológicos, artesanales y musicales, elementos identitarios de la vida de este pueblo. El Museo está distribuido en cuatro áreas.
Ubicado en el ingreso a la Parroquia de Peñaherrera su nombre deriva de una imagen del Señor de Intag que fue colocada en el Río Cristopamba hace más de 100 años.
Refugio tienen una prodigiosa cantidad de orquídeas y otras flores, de árboles (incluyendo el árbol medicinal Sangre de drago), y de varias epifitas (plantas que crecen sobre otras plantas), como las bromelias.
Los artesanos con increíble creatividad elaboran una gran variedad de artículos de cuero de calidad como billeteras, carteras, cinturones, maletas, zapatos, ropa, entre otros que se comercializan en los almacenes de la ciudad y en el exterior.
Es un café arábigo de altura cultivado bajo sombra producido por sobre los 1500 msnm, lo que le otorga una excelente calidad organoléptica, intensa acidez, muy agradable sabor, exquisito aroma y buen cuerpo.
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Conserva un estilo neoclásico que combina la arquitectura griega y romana. Luce majestuosa en su altar mayor la imagen de Santa Ana, Patrona del Cantón, que fue adquirida a la comunidad de Azama y a la que veneran muchos devotos.